Al igual que su torre, la iglesia destaca también por su decoración mudéjar, tanto en el exterior del ábside poligonal, datado en el  siglo XIV y que se corresponde con la primitiva factura del templo gótico, como en el interior. Consta de una sola nave cubierta de bóveda de crucería simple con capillas entre los contrafuertes. En la primera mitad del siglo XVI se decidió ampliar la iglesia levantando un nuevo tramo en los pies de la nave, cubierto con bóveda de crucería estrellada, donde se ubicó el coro.  

A la nave central se abren diversas capillas que albergan retablos datados entre los siglos XVI al XVIII, algunos de ellos fruto del mecenazgo de familias ilustres de la localidad, como es el caso del retablo de la Anunciación, ubicado en la capilla de los Ciria. Junto a ella se encuentra la capilla de la Soledad, en la que en Semana Santa se ubica el espectacular monumento, un bello ejemplo de la llamada “arquitectura efímera” datable en el siglo XVIII, o quizá ya en el XIX..

En el lado de la Epístola, la espectacular portada de la capilla de la Virgen de la Peana nos conduce a un fastuoso interior barroco, parcialmente oculto por un baldaquino realizado a principios del siglo XX que sirve de camarín de la imagen de la Virgen, una delicada talla del siglo XVI. En los laterales encontramos dos lienzos con escenas de la procesión de la Virgen del siglo XIX. 

El retablo mayor está realizado a mediados del siglo XVII y se dedica a la Asunción de Nuestra Señora. Un bello y armónico conjunto de talla y pintura realizado entre los años 1657 y 1661. La delicada ejecución de este retablo, coordinada por Martín del Almunia, se pone de manifiesto en la policromía y estofado de sus tallas, algunas de las cuales poseenincrustaciones de cristal en los ojos, algo inusual en la imaginería de nuestra comarca.

Además, como piezas de gran interés encontramos el terno de San Blas y el delantealtar que con él hace juego, obras del siglo XVI, realizada la primera por Domingo García, un magnífico bordador profesional que trabajó en Ateca durante esos años centrales de la centuria, y la segunda por el taller del maestro.

Presidiendo el coro encontramos un Cristo crucificado, magistral imagen datable a finales del siglo XIII. En un lateral del mismo se ubica el órgano, una magnifica pieza realizada en Cuenca en 1802, acorde estilísticamente con los gustos decorativos empleados durante el reinado de Carlos IV.

La sacristía alberga una serie de vitrinas en las que se muestran piezas de orfebrería y útiles de culto de diversas épocas y estilos, entre las que destacan varias custodias y relicarios además de la magnífica cruz procesional de plata, obra de Onofre Lobera de 1766.

Muy próximo a la iglesia, en el mismo espolón que domina la población desde lo alto se encuentra el antiguo fuerte, hoy rehabilitado como hospedería. De probable origen musulmán (siglo X), es un bastión de grandes dimensiones y lo que hoy se conserva es una construcción carlista del siglo XIX.

Este castillo fue uno de los más importantes de la zona en época medieval, pues controlaba el paso hacia la vecina Castilla. Pasó definitivamente a manos cristianas ya en el siglo XII, cuando la villa fue conquistada en el año 1120 por Alfonso I. Este castillo desempeñó un importante papel en la Guerra de los Dos Pedros, a mediados del siglo XIV, y llegó a ser ocupado por las tropas castellanas. La parte más llamativa es la torre-puerta enmarcada por alfiz que conserva sobre ella el matacán que la protegía.

En uno de los extremos del fuerte carlista, sobre los basamentos de una torre medieval que se asienta sobre las peñuelas, se alza la torre del Reloj, construida en el año 1560 para ubicar la maquinaria realizada por Pedro Malvalet en 1475. La nueva obra civil pudo llevarse a cabo gracias a la labor conjunta de dos constructores de origen vizcaíno, como eran Joan Pérez y maese Domingo, y un alarife de origen islámico como fue Gabriel Meçot. El cuerpo central de la torre alberga dos pisos decorados con trabajos de tradición mudéjar y en el inferior se ubica el reloj elaborado por Francisco Echecoin en el año 1854.

Alcocer ha sido, durante siglos, uno de los enclaves mencionados en el Cantar del Mio Cid que más controversias ha suscitado como consecuencia de la imposibilidad de encontrar un espacio asociado a dicho topónimo. Los hallazgos arqueológicos descubiertos en sucesivas campañas de excavación han terminado por confirmar lo relatado en los propios versos del Poema en los que, tras pasar por Ariza, Cetina, Bubierca y Ateca, el Cid plantó su campamento en un otero “redondo, fuerte y grande”, quizá en el lugar conocido como Torrecid, frente a la actual Mora Encantada, donde se han hallado los vestigios del enigmático lugar de Alcocer.

Este paraje se halla situado en la margen izquierda del río Jalón, muy cerca de la antigua carretera Nacional II, entre Ateca y Terrer, donde lo ubica el propio Cantar. El yacimiento arqueológico, al que denominaremos Alcocer, ocupa la cima de un pequeño cerro que domina la vega del río Jalón, siendo fácilmente identificable por el prominente farallón arcilloso que lo remata. Las diferentes campañas de excavación realizadas han permitido encontrar estructuras habitacionales en las que se han hallado diferentes piezas de uso común (ataifores, tazas, jarros, redomas, candiles, cazuelas, ollas, tapaderas y tinajas) así como vajilla de lujo como la loza dorada, todo ello datable en el siglo XI, coincidente con la existencia del Cid.